Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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CASQ1P31415 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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