Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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