Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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