Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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