Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms