Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SETBP1Q9Y6X0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETBP1Q9Y6X0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms