Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC61Q9Y6R9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms