Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms