Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXC10Q9NYD6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms