Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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