Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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UBE2E2Q96LR5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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UBE2E2Q96LR5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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UBE2E2Q96LR5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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UBE2E2Q96LR5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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UBE2E2Q96LR5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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