Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC59Q96AG4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC59Q96AG4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms