Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms