Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms