Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDRF1Q3B7T1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms