Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT24Q2M2I5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT24Q2M2I5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms