Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms