Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD1Q16676 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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FOXD1Q16676 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD1Q16676 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
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