Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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