Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms