Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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COL19A1Q14993 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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COL19A1Q14993 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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COL19A1Q14993 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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COL19A1Q14993 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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COL19A1Q14993 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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COL19A1Q14993 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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COL19A1Q14993 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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COL19A1Q14993 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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