Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAT1Q14517 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms