Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
RUNX3Q13761 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms