Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATMQ13315 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATMQ13315 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATMQ13315 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms