Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 EIF4G2-226ENST00000532570 573 ntTSL 510.02□□□□□ -0.818e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.938e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-212ENST00000528562 601 ntTSL 46.28□□□□□ -1.48e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-206ENST00000525972 584 ntTSL 26.23□□□□□ -1.418e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -25e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.337e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.267e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.137e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.357e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 59.82□□□□□ -0.847e-8■■■□□ 18
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ILF3Q12906 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.425e-9■■■□□ 18
ILF3Q12906 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.418e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 KLHL23-203ENST00000437875 895 ntTSL 35.84□□□□□ -1.478e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.825e-9■■■□□ 18
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ILF3Q12906 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.766e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 SLC5A6-204ENST00000412471 917 ntTSL 528.96■■■□□ 2.237e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-206ENST00000426119 676 ntTSL 323.61■■□□□ 1.377e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PITPNB-206ENST00000460566 592 ntTSL 419.26■□□□□ 0.676e-14■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.586e-14■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.536e-14■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-207ENST00000428518 570 ntTSL 416.28■□□□□ 0.27e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-208ENST00000430186 599 ntTSL 416.25■□□□□ 0.197e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-205ENST00000414408 741 ntTSL 515.31■□□□□ 0.047e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -07e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.076e-14■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-202ENST00000401463 732 ntTSL 313.86□□□□□ -0.197e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-210ENST00000442731 542 ntTSL 413.77□□□□□ -0.217e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PITPNB-204ENST00000436663 590 ntTSL 213.18□□□□□ -0.36e-14■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.366e-14■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-211ENST00000445802 871 ntTSL 511.57□□□□□ -0.567e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-217ENST00000488743 3174 ntTSL 211.17□□□□□ -0.627e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.677e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PITPNB-203ENST00000415296 884 ntTSL 310.76□□□□□ -0.696e-14■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 SLC5A6-209ENST00000432106 725 ntTSL 310.52□□□□□ -0.737e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 CDK19-206ENST00000463016 604 ntTSL 52.96□□□□□ -1.941e-6■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.883e-13■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.851e-10■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.291e-10■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-13■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.143e-13■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-13■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.753e-13■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.773e-13■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.883e-13■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 DNM2-212ENST00000588976 536 ntTSL 512.65□□□□□ -0.383e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 PCBP2-224ENST00000552980 527 ntTSL 32.99□□□□□ -1.931e-39■■■□□ 17.9
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ILF3Q12906 TFB1M-201ENST00000367166 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■□□ 17.9
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ILF3Q12906 TFB1M-208ENST00000489874 563 ntTSL 32.85□□□□□ -1.953e-6■■■□□ 17.9
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ILF3Q12906 IGF2BP3-209ENST00000474105 663 ntTSL 44.96□□□□□ -1.626e-11■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 526.08■■□□□ 1.776e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 EIF4G3-208ENST00000438975 1270 ntTSL 520.15■□□□□ 0.826e-7■■■□□ 17.9
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ILF3Q12906 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.126e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 EIF4G3-202ENST00000356916 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.996e-7■■■□□ 17.9
ILF3Q12906 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-7■■■□□ 17.8
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ILF3Q12906 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.593e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.642e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-214ENST00000628216 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-213ENST00000626025 616 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-208ENST00000434018 523 ntTSL 39.13□□□□□ -0.952e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNF133-202ENST00000360010 481 ntTSL 58.5□□□□□ -1.052e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.157e-7■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 GAB3-201ENST00000369568 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.26□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 GAB3-202ENST00000369575 4718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 GAB3-206ENST00000496390 4240 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.513e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 AKAP10-202ENST00000395536 1815 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.883e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 AKAP10-209ENST00000578898 475 ntTSL 37.59□□□□□ -1.193e-9■■■□□ 17.8
ILF3Q12906 AKAP10-211ENST00000583951 236 ntTSL 35.9□□□□□ -1.463e-9■■■□□ 17.8
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