Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABP4P57796 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CABP4P57796 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CABP4P57796 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CABP4P57796 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CABP4P57796 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CABP4P57796 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CABP4P57796 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABP4P57796 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABP4P57796 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABP4P57796 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms