Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP98P52948 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP98P52948 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP98P52948 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP98P52948 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms