Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCLMP48507 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCLMP48507 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GCLMP48507 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms