Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms