Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA4P35212 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA4P35212 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA4P35212 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJA4P35212 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJA4P35212 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJA4P35212 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJA4P35212 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJA4P35212 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GJA4P35212 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms