Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRS3P32247 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRS3P32247 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms