Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms