Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA1P25786 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMA1P25786 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms