Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPHA1P21709 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms