Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XBP1P17861 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XBP1P17861 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XBP1P17861 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XBP1P17861 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XBP1P17861 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XBP1P17861 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XBP1P17861 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XBP1P17861 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XBP1P17861 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms