Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODC1P11926 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODC1P11926 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODC1P11926 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODC1P11926 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms