Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHOP08100 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHOP08100 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOP08100 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOP08100 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOP08100 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOP08100 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOP08100 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOP08100 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOP08100 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHOP08100 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHOP08100 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHOP08100 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOP08100 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms