Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms