Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF5O00463 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF5O00463 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms