Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms