Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSDA5PKW4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSDA5PKW4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms