Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTNNA3Q9UI47 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms