Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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DKK3Q9UBP4 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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DKK3Q9UBP4 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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DKK3Q9UBP4 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
DKK3Q9UBP4 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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