Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms