Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 SLC25A14P1-201ENST00000502867 901 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 TRERF1-204ENST00000372922 7286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 SLITRK1-201ENST00000377084 5189 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP34Q70CQ2 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms