Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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