Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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