Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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