Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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