Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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